Pierwsza wzmianka o Kobylnicy pochodzi z przywileju królewskiego, wydanego w roku 1557.
Cerkiew murowana, greckokatolicka, po 1947 r. przez wiele lat była nieużytkowana, potem przejęta przez kościół katolicki jako kościół filialny parafii Potok Jaworowski. Od 1985 r. wykorzystywana wspólnie z wiernymi wyznania greckokatolickiego.
W latach 1977-1981 Kobylnica nosiła nazwę Kopytów Górny.